在糖基生物合成及代谢通路方面，存在差异的通路主要是脂多糖生物合成、脂多糖生物合成蛋白、鞘糖脂生物合成ganglio系列, 鞘糖脂生物合成globo系列和糖胺聚糖降解（图5b）。

近日，锐翌基因协助西南医科大学附属医院在《Acta Dermato-Venereologica》发表了《Patients with Acne Vulgaris Have a Distinct Gut Microbiota in Comparison with Healthy Controls》，其中微生物16S扩增子测序分析工作由锐翌基因完成。今天就带大家一起来了解一下这篇文章的精彩内容！

题目：Patients with Acne Vulgaris Have a Distinct Gut Microbiota in Comparison with Healthy Controls

43例未经治疗的痤疮患者和43例年龄性别匹配的健康对照，每组各26名男性

AS，痤疮患者；CS，健康人群

无菌采样管收集粪便，30min内保存于-80°C中

16S rDNA测序V3-V4区，Illumina Hiseq PE250

1、痤疮患者与健康人群的基本特征

两组的年龄、性别和BMI值均没有差异，年龄为14~25岁，BMI值小于24 kg/m2，病程为37.32 ± 7.84月。

与健康人群相比，痤疮患者体内肠道微生物的多样性显著降低。

不同患病程度人群的alpha多样性差异不显著。

a. simpson指数；b. shannon指数；c. simpson指数；d. shannon指数

由Venn图显示结果可知，AS和CS组中共有OTU数目为590，特有OTU数目分别为52和60；由PCA分析可知，两组的微生物组成存在差异。

基于weighted Unifrac聚类的beta多样性分析，结果显示两组组成差异显著，在OTU水平下，患病组与健康组肠道菌群结构存在显著差异。

a. 细菌OTU的Venn图；b. 基于OTU丰度的PCA分析; 

c. Anosim分析图；d. beta多样性热图

基于秩和检验分析可知，在患病组中，门水平上， Firmicutes丰度降低，Bacteroidetes丰度升高；19个在属水平上存在差异的分类群大部分属于Firmicutes属。

基于LEfSe差异分析可知，在痤疮患者和健康人群中有38个差异丰富的分类群。其中，仅有Bacteroidetes，Bacteroidia 和 Bacteroidales在患病组中富集；Clostridia，Clostridiales，Lachnospiraceae 和 Ruminococcaceae在健康组中显著富集。                             

基于不同分类水平差异物种的PCA分析可知，可以利用38个不同的分类群分离出健康组和患病组；基于属水平差异物种的PCA分析可知，可以利用19个属水平上的物种将患病组和健康组分开。                                   

a. 痤疮患者和健康人群样品的LEfSe分析；b. 丰度前20的微生物类群在不同分类水平上的boxplot；c. 不同微生物类群在属水平上的boxplot

a. 38个分类群的PCA分析；

b. 19个属水平上的PCA分析

运用PICRUSt软件结合KEGG数据库对通路进行注释，在第2、3层级分别注释出10和23个显著差异通路，膜转运蛋白和糖基生物合成及代谢通路表现出明显的差异。

在膜转运蛋白方面，存在差异的通路主要是转运蛋白和 ABC转运蛋白。

在糖基生物合成及代谢通路方面，存在差异的通路主要是脂多糖生物合成、脂多糖生物合成蛋白、鞘糖脂生物合成ganglio系列, 鞘糖脂生物合成globo系列和糖胺聚糖降解。

a. 第2层级差异通路分析；b. 第3 层级差异通路分析

1、与健康人群相比，痤疮患者中肠道微生物多样性降低。

2、在患病组中， 在门水平上，Firmicutes/Bacteroidetes的值降低，可能与炎症疾病相关。

3、在健康组中显著富集的分类群是Clostridia，Clostridiales，Lachnospiraceae 和Ruminococcaceae。

4、痤疮患者与健康人群在膜转运蛋白和糖基生物合成及代谢通路表现出明显的差异。