普通人群中便秘患病可高达27%，患病率除存在地区差异外，与流行病学研究样本选取、所采用的便秘判断标准以及调查的方式等有关。我国的整群随机流行病学调查资料表明成人符合慢性便秘的患病率为3.6%～40.1%。女性患病率高于男性，男女之比为1：1.77～1：4.59。慢性便秘的发生与饮食、疲劳、精神状态有关。高脂饮食、女性吸烟、低体质指数、低文化者更易发生便秘。在我国，农村便秘患病率高于城市。

国内外研究资料显示，与功能性便秘相关或加重的因素包括：①纤维素摄入不足。②身体状况较差、缺乏体力劳动。③内分泌功能紊乱。④精神心理障碍。⑤受虐待。⑥早期排便训练不佳、受家庭成员中便秘患者的影响。⑦对排便功能的不认知等。老年人中，因为同时存在的基础疾病（如甲状腺功能低下、糖尿病周围神经病变、帕金森病等）以及合并用药可能成为影响便秘的重要因素。

低体质指数慢性便秘的患病体质指数超过25kg/m2者高（7.1%比2.6%），这可能与低体质指数中肌肉张力有关。多项调查显示重体力劳动者慢性便秘发生，可能与全身较多运动有助于肠道蠕动，而长期脑力劳动、活动较少会减慢肠道活动有关。在慢性便秘患者中，低体质指数中空腹和餐后血浆胃动素水平低于体质指数正常和高体质指数，胃动素对消化期间胃移行性复合运动、胃肠道通过时间和结肠收缩具有促进作用。但也有研究发现，在老年便秘患者中，体力活动强度与正常对照者并无差异，体力活动量与结肠传输时间并无相关性。

慢传输型功能性便秘多发于育龄期妇女，女性激素紊乱在慢传输性便秘的发病中有重要作用。研究发现：慢传输性便秘患者浓度升高，孕激素可以降低环形肌和纵行肌的收缩力，抑制纵行肌的收缩频率，该抑制效应存在剂量反映关系；孕激素对纵行肌和环形肌的抑制作用可被维拉帕米拮抗，推测孕激素可能是通过改变胞质高浓度来发挥对结肠平滑肌的抑制作用。同时慢传输性便秘患者催乳素、雌二醇等也发生变化。女性慢传输便秘患者结肠过度表达孕激素受体，引起结肠收缩性G蛋白表达下降，抑制性G蛋白表达上调。孕激素受体B的过度表达引起女性慢传输型便秘患者结肠平滑肌细胞对黄体酮的高敏感性。

精神心理因素对功能性便秘的影响越来越受到重视。再有功能性便秘症状的人群中，74.8%自认为便秘症状的发作与情绪不良有关，负性生活事件是便秘的影响因素。男性和女性慢性便秘者合并抑郁的比例分别为26.9%和40.0%，女性便秘患者精神心理障碍与便秘的严重程度关系更大。应用症状自评表（SCL-90）和便秘患者自评生活质量量表（Patient Assessment of Constipation  Qualiaty  of  life,PAC-QOL）对慢传输性便秘患者进行调查，发现SCL-90各项评分显著高于健康对照，PAC-QOL的４个部分得分和总平均分均明显增高，说明功能性便秘患者存在明显的精神心理异常，生活质量严重下降。精神心理障碍可通过抑制外周自主神经对结肠的支配，也可影响下丘脑和自主神经系统，尤其是抑制副交感神经 ，导致结肠传输时间延长，从而引起便秘。精神心理因素还可以影响胃肠激素的分泌，导致胃肠功能紊乱。除精神心理因素外，４４％慢性便秘患者存在睡眠障碍，睡眠障碍或长期服用催眠药物可加重便秘。

香港的一项研究显示，一级亲属中有特发性便秘家族史功能性便秘患者其便秘发病年龄更早（１１～２０岁），便秘病程更长，患者更常使用手法辅助排便，且易出现便秘等并发症，如痤疮出血、肛裂、直肠脱垂等。表明家庭社会学习行为和应对方式影响功能性便秘的发病和预后。